1. MPM學生應於碩二上開學前確定論文指導教授，並將本單繳回辦公室。

2. 指導教授必須為清華大學科技管理學院專任老師，若院內專任老師認為有必要與院內兼任老師或院外老師共同指導，需經各專班委員會同意。

3. 學生在學期間必須曾修習該指導教授之課程。

4. 每位指導教授每學年可指導之MPM學生以6人為上限；共同指導則每位教授所指導之學生則以7人為限(單獨指導5人+共同指導2人)。